2013年一項義大利人體研究說明，紅麴萃取物可以降低人體中的發炎指標C- 反應蛋白（CRP）與總膽固醇數值。營養師陳怡潔表示，研究結果指出，紅麴有抗慢性發炎、預防慢性病的功效。

近年來經科學研究指出，紅麴菌發酵的過程中會產生許多代謝物質，其中包含一種叫做紅麴菌素K（Monacolin K）的成分。最早是由一位日本學者遠騰教授從紅麴中分離出來，後來也有美國學者找出該成分抑制膽固醇合成的作用機轉，美國《臨床營養學期刊》在1999年2月發表一篇報導，經試驗，每人每天吃2.4克紅麴粉，8週後壞膽固醇明顯降低。多項研究讓紅麴聲名大開，被認為有抑制膽固醇合成、降血壓等多重保健功能，當然也被開發成各類健康食品。

紅麴在《天工開物》、《本草綱目》、《中藥大辭典》等典籍中的記載，主要有「活血、健脾消食」的功效。 中醫師周宗翰就表示，紅麴味甘性溫，能活血化瘀、調節血脂，除了推薦高血脂者攝取，還可預防心腦血管疾病。

紅麴常用以幫食物染色：如紅蛋、紅糟肉、各種食品加工。另外，國立自然科學博物館的網站資訊介紹，《天工開物》一書還曾提及紅麴的防腐效果，「世間魚肉最腐朽物，而此物薄施塗抹，能固其質於炎暑之中，經歷旬日，蛆蠅不敢近，色味不離初，蓋奇藥也」。因為紅麴的紅麴內酯、紅麴紅素與紅斑素可以殺死大腸桿菌、痢疾桿菌、假單胞菌屬、枯草芽孢桿菌。

紅麴功效： 降膽固醇、預防心血管疾病，紅麴發酵後，不僅含有紅麴色素，還會產生Monacolin K（又稱莫那可林K、紅麴菌素K）及類黃酮等成分；其中，Monacolin K的功效，與可降血脂的Statins（史他汀）類藥物相似，能抑制體內膽固醇合成，有助於降低血脂濃度，減少罹患高膽固醇血症、動脈硬化與心血管疾病的風險。

高膽固醇救星「紅麴」抗癌、補骨，潛在好處多，紅麴則是來自傳統中華飲食的養生智慧，更因為優異的降膽固醇效果，一路紅到日本、歐美醫學界。紅麴的最主要功效成分「紅麴菌素K(Monacolin K)具有抑制膽固醇合成的作用，結構與Statin類的降膽固醇藥物Lovastatin相似，有助於降低血壓、總膽固醇及低密度膽固醇，達到心血管的防護。此外，部分研究也發現紅麴菌素具有抑制癌細胞生長的防癌功效，並可透過減少血液中的膽固醇，間接減少阿茲海默症的發生。目前針對紅麴菌素密切展開中的還有關於改善骨質疏鬆的研究，在動物及細胞實驗中發現，給予紅麴具有增加骨質密度、降低骨降解並促進造骨細胞的增生，或許有機會延緩骨質疏鬆的症狀。